Scrat jagter stadig den evigt undslippende nød, som han har forsøgt at fange siden tidernes morgen. Nu har hans skøre jagt dog konsekvenser for verden, da han udløser en kontinental naturkatastrofe. Manfred, Sid og Diego kommer væk fra resten af flokken, da kontinenterne deler sig, og med Sids stride bedstemor på slæb støder de ind i både søuhyrer og en gruppe pirater, der gør alt for at forhindre vennerne i at komme hjem igen.