Les communications entre Eureka et le monde extérieur sont perturbées par un nuage de poussière intelligente. Jack et le docteur Fargo tentent alors de le maîtriser avant qu'il n'affecte les fonctions cérébrales des habitants. Jo, quant à elle, apporte son aide à Henry afin d'innocenter Grace, impliquée dans une affaire d'espionnage. De son côté, Holly reçoit un message qui provoque un changement dans son comportement...