L'histoire se déroule sur l'exoplanète Gift dont le sol est riche en cristaux appelés Giftjium. Ces derniers assurent la prospérité de nombreuses villes minières, dont celle de Garden Indigo, où vit Sôgo Amagi, un orphelin passionné par les cristaux. Une passion transmise par sa mère qui était chercheuse. Un jour, alors qu'il est descendu dans la mine avec d'autres élèves de sa classe, il est bousculé par une émeute et se perd. C'est en cherchant à retrouver son chemin vers la surface qu'il rencontrera Felia, une étrange jeune fille qui semble vivre là.